Identificación de Mycobacteria no pigmenteda de crecimiento rápido por el Método Molecular de Micobacterium de Genotipo CM / Identification of Fast-Growing Non-Pigmented Mycobacteria by the Genotype® Mycobacterium CM Molecular Method

Introducción: la micobacteria no terberculosa (NTM) forma un grupo heterogéneo de microorganismos que pueden causar infección en humanos. Las micobacterias no pigmentadas de rápido crecimiento (MNPCR) son de interés clínico debido al creciente número de pacientes infectados por ellos y a la dificultad del tratamiento. Dentro de este grupo, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium abscessus y Mycobacterium chelonae son reconocidos como patógenos potenciales; estas especies se han aislado de infecciones pulmonares y extrapulmonares. Objetivo: el objetivo de este trabajo es encontrar la frecuencia de aislamiento de especies micobacterianas de rápido crecimiento, específicamente el complejo Mycobacterium fortuitum, de muestras clínicas utilizando la técnica molecular de diagnóstico GenoType Mycobacterium CM. Material y Método: se analizaron 249 aislados de micobacterias no tuberculosas obtenidas de muestras pulmonares y extrapulmonares de pacientes sintomáticos en el período enero 2018-diciembre de 2022. La técnica molecular GenoType Mycobacterium CM se utilizó para identificar la especie. Resultados: Se obtuvieron 77 (3,9%) aislados de especies no pigmentadas de rápido crecimiento, estas se identificaron en orden decreciente: Mycobacterium fortuitum 65 (84,41%), Mycobacterium abcessus 9 (11,68%) y Mycobacterium chelonae 3 (4%). Conclusiones: los resultados reafirman que el complejo Mycobacterium fortuitum es responsable de la mayoría de las infecciones causadas por la micobacteria en rápido crecimiento en humanos. La técnica diagnóstica GenoType Mycobacterium CM es una herramienta útil para la rápida identificación de micobacterias; proporciona resultados precisos en menos tiempo, acortando significativamente el tiempo diagnóstico, permite la aplicación temprana de tratamiento específico, evitando así la propagación de la infección.

Introduction: non-tuberculous mycobacteria (NTM) form a heterogeneous group of mi-croorganisms that can cause infection in humans. Fast-growing non-pigmented my-cobacteria (MNPCR) are of clinical interest due to the increasing number of patients infected by them and the difficulty of treatment. Within this group, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium abscessus and Mycobacterium chelonae are recognized as potential pathogens; these species have been isolated from both pulmonary and ex-trapulmonary infections. Objective: the objective of this work is to find the frequency of isolation of fast-growing non-pigmented mycobacterial species, specifically the Myco-bacterium fortuitum complex, from clinical samples using the GenoType® Mycobacteri-um CM diagnostic molecular technique. Material and Method: 249 isolates of non-tu-berculous mycobacteria obtained from pulmonary and extrapulmonary samples from symptomatic patients in the period January 2018-December 2022 were analyzed. The G e n oTy p e® Mycobacterium CM molecular technique was used to identify the species. Results: 77 (30.9%) isolates of fast-growing non-pigmented species were obtained, these were identified in decreasing order: Mycobacterium fortuitum 65 (84.41%), Myco-bacterium abcessus 9 (11.68%) and Mycobacterium chelonae 3 (4%). Conclusions: the results reaffirm that the Mycobacterium fortuitum complex is responsible for most in-fections caused by fast-growing mycobacteria in humans. The GenoType® Mycobacte-riumCM diagnostic technique is a useful tool for the rapid identification of mycobacte-ria; it provides accurate results in less time, significantly shortening the diagnostic time, it allows the early application of specific treatment, thus avoiding the spread of infec-tion.

Linfadenitis por Mycobacterium en pacientes inmunocompetentes y viviendo con VIH/sida / Lymphodenitis by Mycobacterium in immunocompetent and living with HIV/AIDS patients

Introducción: La coinfección del virus de inmunodeficiencia humana (VIH) y la tuberculosis ha alterado su presentación histológica, esto es particularmente frecuente en las linfadenitis. Objetivos: Realizar la caracterización etiológica de linfadenopatías producidas por el género Mycobacterium, destacar la importancia del diagnóstico precoz de esta enfermedad para evitar diseminación de la infección, tanto en pacientes inmunocompetentes como inmunodeficientes, específicamente con VIH/sida. Método: Se realizó estudio descriptivo-prospectivo entre enero de 2017 y enero de 2019. Durante este período se recibieron 5640 muestras, de estas 81 obtenidas a partir de tejido ganglionar; la toma de muestra mayoritariamente fue quirúrgica 74 (91,35 por ciento) y 7 (8,64 por ciento) por biopsia aspirativa (BAAF). Del total de muestras, 60 (74,07 por ciento) procedían de pacientes con VIH/sida, las muestras se descontaminaron por el método de ácido sulfúrico al 4 por ciento, se cultivaron en medio sólido Löwenstein-Jensen e incubaron a 37°C. Se realizaron lecturas semanalmente. Para identificar Mycobacterium tuberculosis se realizó la prueba rápida comercial inmunocromatográfica SD TB AgMPT64. Resultados: De 81 muestras analizadas se obtuvieron 22 (27,16 por ciento) aislamientos, 16 (72,72 por ciento) de Mycobacterium tuberculosis, y 6 (27,27 por ciento) de especies no tuberculosas. De estas, 18 (81,81 por ciento) procedían de pacientes con VIH/sida. Conclusión: Por todo lo antes expuesto es importante la vigilancia diagnóstica en este tipo de infección extrapulmonar, tanto para M. tuberculosis como para otras especies no tuberculosas y poder comenzar tempranamente el tratamiento específico evitando la diseminación de la infección, pues esta puede tener consecuencias fatales, sobre todo en pacientes con algún tipo de inmunosupresión, como aquellos con VHI/sida. Si un paciente mantiene fiebre prolongada, con linfadenopatías, sin síntomas respiratorios y no responde a los tratamientos con antibióticos, es necesario pensar en este tipo de infección(AU)

Introduction: The coinfection of human immunodeficiency virus (HIV) and tuberculosis has altered its histological presentation; this is particularly frequent in lymphadenitis. Objective: To carry out the etiological characterization of lymphadenopathies produced by the genus Mycobacterium, highlighting the importance of early diagnosis of this disease to avoid dissemination of the infection, both in immunocompetent and immunodeficient patients, specifically HIV / AIDS. Methods: A descriptive-prospective study was carried out between January 2017 - January 2019. During this period, 5640 samples were received, of these 81 obtained from lymph node tissue, the sample collection was mostly surgical 74 (91.35 percent) and 7 (8.64 percent) by aspiration biopsy (BAAF). Of the total samples, 60 (74.07 percent) were from HIV / AIDS patients, the samples were decontaminated by the 4 percent sulfuric acid method and cultured in solid Löwenstein-Jensen medium and incubated at 370C, the readings were made weekly. For the identification of Mycobacterium tuberculosis, the commercial SD TB AgMPT64 immunochromatographic rapid test was performed. Results: Of 81 samples analyzed, 22 (27.16 percent) isolates were obtained, 16 (72.72 percent) of Mycobacterium tuberculosis (MTB), and 6 (27.27 percent) of non-tuberculous species, of these 18 (81.81%) were from HIV / AIDS patients. Conclusion: For all the above, diagnostic surveillance is important in this type of extrapulmonary infection, both for M tuberculosis and for other non-tuberculous species and to be able to start specific treatment early, avoiding the spread of the infection, since it can have fatal consequences on all in patients with some type of immunosuppression, such as HIV/AIDS. If a patient maintains a prolonged fever, with lymphadenopathy, without respiratory symptoms and does not respond to antibiotic treatment, it is necessary to consider this type of infection(AU)

Evaluación del método de Petroff modificado con solución salina para el diagnóstico de micobacterias en el sistema Bact/Alert 3D / Assessment of Petroff method modified with saline solution for the diagnosis of mycobacteria in Bact/Alert 3D system

Introducción: Existen diferentes métodos de descontaminación de muestras pulmonares para el diagnóstico de micobacterias. El Programa Nacional de Control de Tuberculosis recomienda el método de Petroff modificado con solución salina, pero no existen evidencias documentadas que avalen este método. Objetivo: Evaluar el método de Petroff modificado con solución salina para el diagnóstico de micobacterias en el sistema Bact/Alert 3D. Métodos: Se realizó un estudio observacional analítico de pruebas diagnósticas utilizando 100 muestras pulmonares recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias del Instituto Pedro Kourí, abril 2016 enero 2017. La muestra se dividió en 3 alícuotas y se descontaminaron mediante 3 métodos; luego se inocularon en los medios de cultivo sólido y líquido. Se compararon los resultados del cultivo en cuanto: tiempo de detección de crecimiento, tasa de contaminación, por ciento de positividad, además se calcularon indicadores de desempeño. Resultados: Al comparar el método Petroff modificado con solución salina con el Petroff modificado con solución fosfato en Löwenstein Jensen, el tiempo de detección de crecimiento, por ciento de positividad y la tasa de contaminación se comportaron de forma similar y la sensibilidad (93,75 por ciento), concordancia (96,47 por ciento) e índice de Youden (0,91) fueron elevadas. Al compararlo el Petroff modificado con solución salina con el N-Acetil-L-Cisteína, las variables no mostraron diferencias significativas y los Indicadores de Desempeño se comportaron por encima del 93 por ciento, para el medio sólido y líquido. Conclusiones: Los resultados avalan la continuidad del uso del Petroff modificado con solución salina como método de descontaminación de las muestras pulmonares en la red de laboratorios de Cuba y como alternativa en el pretratamiento de las muestras para el medio líquido (Bact/Alert 3D), además constituye un soporte para el Programa Nacional de Control de Tuberculosis(AU)

Introduction: There are different decontamination methods of pulmonary samples for the diagnosis of mycobacteria. The National Program for the Control of Tuberculosis recommends Petroff method modified with saline solution; but there are not documented evidences that endorse it. Objective: Assess Petroff method modified with saline solution for the diagnosis of mycobacteria in Bact / Alert 3D system. Methods: An observational analytic study of diagnostic tests was conducted; there were used 100 pulmonary samples received in the National Laboratory of References and Researches of Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of Pedro Kourí Institute, from April 2016 to January 2017. The sample was divided in 3 aliquots and those were decontaminated using 3 methods; then, they were inoculated in the solid and liquid culture means. Cultures´ results were compared according to: growth's detection time, contamination rate, percent of positivity; in addition, performance indicators were calculated. Results: When comparing Petroff method modified with saline solution with Petroff method modified with phosphate solution in Löwenstein Jensen, the growth's detection time, the percent of positivity and the rate of contamination behaved similarly, and sensitivity (93,75percent), concordance (96,47percent) and Youden´s index (0,91) were high. When the Petroff method modified with saline solution was compared with N-Acetil-L- Cisteina, the variables did not show significative differences and the behaviour indicators were over 93percent for the solid and liquid mean. Conclusions: The results endorse the continuity of the use of Petroff method modified with saline solution as a decontamination method of pulmonary samples in the network of Cuban laboratories and as alternative to the pre-treatment of the samples for the liquid mean (Bact/Alert 3D); it also constitutes a support for the National Program for the Control of Tuberculosis(AU)

Identificación de especies micobacterianas ambientales u oportunistas en pacientes sintomáticos y con VIH/sida / Identification of environmental or opportunistic mycobacterial species in symptomatic symptomatic and HIV/AIDS patients

El aumento de las infecciones por micobacterias ambientales u oportunistas (MAO) coincide mundialmente con el declive de la infección tuberculosa e incremento de la infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). El presente trabajo es un estudio retrospectivo realizado en el Laboratorio Nacional de Referencia-Investigaciones de Tuberculosis/Micobacterias/Lepra (LNRI-TB/Lepra/Micobacterias), del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK), La Habana, Cuba, durante el período enero 2014-diciembre 2018. El objetivo de nuestro estudio fue conocer la variabilidad de especies aisladas para establecer un referente actualizado sobre las infecciones causadas por estas. En este trabajo se clasificaron-identificaron 413 cepas procedentes de pacientes sintomáticos; 162 (39.22%) eran aislamientos de pacientes con VIH/sida atendidos en nuestro Hospital Nacional de Referencia a Atención al paciente VIH/sida (IPK), y el resto (n = 251 [60.77%]), procedentes de pacientes inmunocompetentes, incluyendo aislamientos recibidos de los Centros Provinciales de Higiene, Epidemiología, y Microbiología (CPHEM). Las muestras fueron analizadas con las técnicas convencionales establecidas: las pulmonares fueron descontaminadas por el método de Petroff modificado; las extrapulmonares, por el método del ácido sulfúrico al 4%; el cultivo se realizó en medio de Löwenstein-Jensen modificado. Posteriormente se realizó la clasificación-identificación de especies según el esquema fenotípico-bioquímico establecido. Las especies con mayor porcentaje de aislamiento pertenecieron a los Grupos III y IV, complejo Mycobacterium avium-intracellulare (34.14%) y complejo M. fortuitum (20.82%), respectivamente. Estos resultados permitirán conocer la prevalencia de estas especies en nuestro país, reafirmando la importancia diagnóstica de estos microorganismos para aplicar tratamiento específico, sobre todo en pacientes con factores de riesgo, en quienes es más probable la diseminación de la infección.

The increase in infections by environmental or opportunistic mycobacteria (MAO) coincides worldwide with the decline in tuberculosis infection and an increase in infection by the human immunodeficiency virus (HIV). The present work is a retrospective study carried out at the National Reference Laboratory-Tuberculosis/Mycobacterial/Leprosy Research (LNRI-TB / Leprosy / Mycobacteria), of the Pedro Kourí Institute of Tropical Medicine (IPK), La Habana, Cuba, during the period January 2014-December 2018. The objective of our study was to know the variability of isolated species to establish an updated reference on the infections caused by MAO. In this study, 413 strains from symptomatic patients were classified and identified; 162 (39.22%) were isolates from patients with HIV/AIDS treated at our National Hospital of Reference for Attention to HIV/AIDS patients (IPK), and the remaining (n=251 [60.77%]), from immunocompetent patients, including isolates received from the Provincial Centers of Hygiene, Epidemiology, and Microbiology (CPHEM). The samples were analyzed with the established conventional techniques: the lung samples were decontaminated by the modified Petroff method; the extrapulmonary, by the 4% sulfuric acid method; the culture was carried out in modified Löwenstein-Jensen medium. Subsequently, the classification-identification of species was carried out according to the established phenotypic-biochemical scheme. The species with the highest percentage of isolation belonged to Groups III and IV, Mycobacterium avium-intracellulare complex (34.14%), and M. fortuitum complex (20.82%), respectively. These results will allow us to know the prevalence of these species in our country, emphasizing the diagnostic importance of these microorganisms and thus apply a specific treatment, especially in patients with risk factors, in whom the spread of the infection is more likely

Eliminación de la tuberculosis en Cuba: contribuciones recientes, resultados y desafíos / Elimination of tuberculosis in Cuba: recent contributions, results and challenges

Desde el 70 al 80 Aniversario de la fundación del Instituto de Medicina Tropical "Pedro Kourí", los investigadores, profesionales y técnicos de este centro, han laborado en cooperación con diversas instituciones académicas y de los servicios de salud de Cuba (en equipos multidisciplinarios) en las tareas de desarrollo científico, innovación tecnológica y construcción de capacidades. Este artículo resume las principales investigaciones realizadas sobre la tuberculosis desde 2008-2017; como contribuciones al Programa Nacional de Control y Eliminación de la Tuberculosis con la perspectiva de aumentar la calidad, efectividad y eficiencia de las acciones y acelerar la solución de la incidencia y la mortalidad por tuberculosis, para la investigación, la vigilancia y control de la tuberculosis. Se presentan evidencias que fundamentan las innovaciones en el manejo clínico terapéutico de pacientes inmunocompetentes e inmunocomprometidos, en niños y adolescentes, sobre las indicaciones para el control de la infección tuberculosa latente, la vigilancia de los desenlaces del tratamiento anti-tuberculosis, la investigación de contactos de casos, los cambios en el sistema de registro e información, el monitoreo y evaluación de la calidad de la detección de casos de tuberculosis, el impacto sobre la morbilidad y la mortalidad.

During the period extending from the 70th to the 80th anniversary of the founding of Pedro Kouri Tropical Medicine Institute, researchers, professionals and technicians from the center, in joint cooperation with a variety of Cuban academic and health care institutions, have integrated into multidisciplinary teams engaged in tasks related to scientific development, technological innovation and capacity building. The paper summarizes the main research studies about tuberculosis conducted from 2008 to 2017 as contributions to the National Tuberculosis Control and Elimination Program, with a view to enhancing the quality, effectiveness and efficiency of actions, swiftly finding a solution to tuberculosis incidence and mortality, and fostering tuberculosis research, surveillance and control. Evidence is presented which substantiates innovations in the clinical therapeutic management of both immunocompetent and immunocompromised patients, children and adolescents, and indications are provided for latent tuberculosis infection control, surveillance of anti-tuberculosis treatment outcomes, investigation of case contacts, changes in the record and information system, quality monitoring and evaluation of the detection of tuberculosis cases, and impact on morbidity and mortality.

Contaminación cruzada por Mycobacterium tuberculosis en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis de Cuba / Cross-contamination of Mycobacterium tuberculosis at the National Rference Laboratory of Tuberculosis of Cuba

Introducción: la contaminación cruzada por Mycobacterium tuberculosis (Mtb) en el laboratorio es más común de lo que se piensa.Objetivo: confirmar un posible episodio de contaminación cruzada por Mtb en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias del Instituto Pedro Kouri.Métodos: se realizó un estudio descriptivo y retrospectivo de los indicadores de calidad del cultivo del 3er trimestre de 2014. Se observó un incremento de cultivos positivos a Mtb con codificaciones bajas, durante un día de trabajo. Se encontraron 10 aislamientos de 19 muestras procesadas: ocho con sospecha de contaminación cruzada y dos aislamientos pertenecientes a uno de los pacientes involucrados y que tuvo un cultivo positivo procesado en una fecha diferente. Las muestras se procesaron según lo establecido por el Programa Nacional de Control de la Tuberculosis de Cuba. A los cultivos positivos se les realizó la tipificación con oligonucleótidos espaciadores Spoligotyping.Resultados: el aislamiento de la muestra 1 435 (paciente 1) fue un patrón único al no aparecer en la base de datos internacional SITVIT2. En los cultivos de las muestras 1 438 y 1 439 (paciente 2) se identificó el linaje Beijing (tipo 1). En los siete cultivos restantes (pacientes del 3 al 7) se identificó el linaje S tipo 71; los cultivos posteriores de estos pacientes fueron negativos a excepción del paciente 5 (muestra 1 561), en el que se aisló Mtb con el mismo patrón genético.Conclusiones: los resultados de la genotipificación permitieron confirmar los cultivos positivos contaminados e inferir una posible fuente de contaminación durante ese día de trabajo. También resalta la importancia de identificar eventos de contaminación cruzada, pues puede implicar un mal manejo clínico de los pacientes, así como el uso innecesario de un tratamiento largo y costoso, además de influir en el análisis e interpretación de los resultados desde el punto de vista epidemiológico(AU)

Introduction: cross contamination of Mycobacterium tuberculosis in the laboratory is more common than thought.Objective: to confirm a possible event of cross-contamination of Mycobacterium tuberculosis in the National Reference Laboratory of Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of Pedro Kouri Institute.Methods: a descriptive and retrospective study of quality indicators of culture for the third quarter of 2014 was conducted. An increased Mycobacterium tuberculosis-positive culture with low encodings was observed during a working day. Ten isolates of 19 processed samples were found: eight suspected cross-contamination and two isolates from one of the patients involved and had a positive culture processed on a different date. The samples were processed as established by the National Program for Tuberculosis Control in Cuba .Positive cultures were typed by using oligonucleotide spacers Spoligotyping.Results: the isolation of the sample 1 435 (patient 1) showed a unique pattern that does not appear in the international database SITVIT2. In the culturing of 1 438 and 1 439 samples (patient 2), the Beijing lineage (type 1) was identified. In the remaining seven cultures (patients 3 through 7), the lineage S type 71 was identified. The subsequent cultures of the samples taken from these patients were negative except for patient 5 (sample 1 561) in whom Mtb was isolated with the same genetic pattern.Conclusions: the results of genotyping allowed confirming the contaminated positive cultures and inferring a possible source of contamination during that workday. It also highlights the importance of identifying cross-contamination events, because it may involve poor clinical management of patients and thus the unnecessary use of a long and costly treatment, in addition to influencing the analysis and interpretation of the results from the epidemiological viewpoint(AU)

Contaminación cruzada por Mycobacterium tuberculosis en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis de Cuba / Cross-contamination of Mycobacterium tuberculosis at the National Rference Laboratory of Tuberculosis of Cuba

Introducción: la contaminación cruzada por Mycobacterium tuberculosis (Mtb) en el laboratorio es más común de lo que se piensa. Objetivo: confirmar un posible episodio de contaminación cruzada por Mtb en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias del Instituto Pedro Kouri. Métodos: se realizó un estudio descriptivo y retrospectivo de los indicadores de calidad del cultivo del 3er trimestre de 2014. Se observó un incremento de cultivos positivos a Mtb con codificaciones bajas, durante un día de trabajo. Se encontraron 10 aislamientos de 19 muestras procesadas: ocho con sospecha de contaminación cruzada y dos aislamientos pertenecientes a uno de los pacientes involucrados y que tuvo un cultivo positivo procesado en una fecha diferente. Las muestras se procesaron según lo establecido por el Programa Nacional de Control de la Tuberculosis de Cuba. A los cultivos positivos se les realizó la tipificación con oligonucleótidos espaciadores Spoligotyping. Resultados: el aislamiento de la muestra 1 435 (paciente 1) fue un patrón único al no aparecer en la base de datos internacional SITVIT2. En los cultivos de las muestras 1 438 y 1 439 (paciente 2) se identificó el linaje Beijing (tipo 1). En los siete cultivos restantes (pacientes del 3 al 7) se identificó el linaje S tipo 71; los cultivos posteriores de estos pacientes fueron negativos a excepción del paciente 5 (muestra 1 561), en el que se aisló Mtb con el mismo patrón genético. Conclusiones: los resultados de la genotipificación permitieron confirmar los cultivos positivos contaminados e inferir una posible fuente de contaminación durante ese día de trabajo. También resalta la importancia de identificar eventos de contaminación cruzada, pues puede implicar un mal manejo clínico de los pacientes, así como el uso innecesario de un tratamiento largo y costoso, además de influir en el análisis e interpretación de los resultados desde el punto de vista epidemiológico(AU)

Introduction: cross contamination of Mycobacterium tuberculosis in the laboratory is more common than thought. Objective: to confirm a possible event of cross-contamination of Mycobacterium tuberculosis in the National Reference Laboratory of Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of Pedro Kouri Institute. Methods: a descriptive and retrospective study of quality indicators of culture for the third quarter of 2014 was conducted. An increased Mycobacterium tuberculosis-positive culture with low encodings was observed during a working day. Ten isolates of 19 processed samples were found: eight suspected cross-contamination and two isolates from one of the patients involved and had a positive culture processed on a different date. The samples were processed as established by the National Program for Tuberculosis Control in Cuba .Positive cultures were typed by using oligonucleotide spacers Spoligotyping. Results: the isolation of the sample 1 435 (patient 1) showed a unique pattern that does not appear in the international database SITVIT2. In the culturing of 1 438 and 1 439 samples (patient 2), the Beijing lineage (type 1) was identified. In the remaining seven cultures (patients 3 through 7), the lineage S type 71 was identified. The subsequent cultures of the samples taken from these patients were negative except for patient 5 (sample 1 561) in whom Mtb was isolated with the same genetic pattern. Conclusions: the results of genotyping allowed confirming the contaminated positive cultures and inferring a possible source of contamination during that workday. It also highlights the importance of identifying cross-contamination events, because it may involve poor clinical management of patients and thus the unnecessary use of a long and costly treatment, in addition to influencing the analysis and interpretation of the results from the epidemiological viewpoint(AU)

Importancia diagnóstica de las infecciones extrapulmonares causadas por el género Mycobacterium

Introducción: el género Mycobacterium provoca infecciones pulmonares y extrapulmonares, dentro de estas últimas las localizaciones más frecuentes son; sistema nervioso linfático, central, circulatorio, genitourinario, gastrointestinal, tejido osteoarticular, y la piel. Objetivo: realizar las caracterizaciones etiológica de infecciones extra pulmonares producidas por el género Mycobacterium, destacar su importancia diagnóstica tanto en pacientes VIH- como VIH/sida. Métodos: se realiza un estudio descriptivo-prospectivo de corte transversal realizado de enero 2012 a mayo 2014. Durante este período se recibió un total de 825 muestras, 232 de pacientes VIH- y 593 de pacientes con VIH/sida. Las muestras que lo requerían se le aplicaron descontaminación cultivo, se utilizó el método de ácido sulfúrico al 4 por ciento, para el cultivo se usó el medio de Löwenstein-Jensen. Resultados: de las 825 muestras extra pulmonares en 29 (3,5 por ciento) se obtuvo cultivo positivo, 14 (48,3 por ciento) con aislamiento de Mycobacterium tuberculosis (11 VIH+ y 3 VIH-), y 15 (51,7 por ciento) con aislamiento de otras especies micobacterianas (12 VIH+ y 3 VIH-), Mycobacterium avium-intracellulare, y Mycobacterium malmoense fueron las especies más aisladas. Conclusión: por todo lo anterior expuesto se recomienda mantener la vigilancia diagnóstica en este tipo de infección extra pulmonar, en especial en pacientes con sida, pues en muchos casos pueden tener fatales consecuencias por su diagnóstico tardío(AU)

Introduction: the genus Mycobacterium causes pulmonary and extrapulmonary infections. The most common locations for the latter are the lymphatic and central nervous systems, the circulatory, genitourinary, and gastrointestinal systems, the osteoarticular tissue, and the skin. Objective: to etiologically characterize extrapulmonary infections caused by the genus Mycobacterium and to highlight its diagnostic importance in both HIV-negative and HIV/AIDS patients. Methods: a descriptive-prospective cross-sectional study is carried out from January 2012 to May 2014. During this period, a total of 825 samples, 232 HIV-negative and 593 HIV/AIDS patients were received. The samples that required such were applied cell decontamination culture. The method of sulphuric acid at 4 percent was used. The culture used the Löwenstein-Jensen medium. Results: among the 825 extrapulmonary samples, positive culture was obtained in 29 (3.5 percent), 14 (48.3 percent) with isolation of Mycobacterium tuberculosis (11 HIV-positive and 4 HIV-negative) and 15 (51.7 percent) with isolation from other mycobacterial species (12 HIV-positive and 3 HIV-negative). Mycobacterium avium intracellulare and Mycobacterium malmoense were the most isolated species. Conclusion: in view of what has been previously presented, diagnostic surveillance is recommended to continue for this type of extrapulmonary infection, especially in AIDS patients, because in many cases fatal consequences may happen from delayed diagnostic(AU)

Importancia diagnóstica de las infecciones extrapulmonares causadas por el género Mycobacterium / Diagnostic importance of extrapulmonary infections caused by the genus Mycobacterium

Introducción: el género Mycobacterium provoca infecciones pulmonares y extrapulmonares, dentro de estas últimas las localizaciones más frecuentes son; sistema nervioso linfático, central, circulatorio, genitourinario, gastrointestinal, tejido osteoarticular, y la piel. Objetivo: realizar las caracterizaciones etiológica de infecciones extra pulmonares producidas por el género Mycobacterium, destacar su importancia diagnóstica tanto en pacientes VIH- como VIH/sida. Métodos: se realiza un estudio descriptivo-prospectivo de corte transversal realizado de enero 2012 a mayo 2014. Durante este período se recibió un total de 825 muestras, 232 de pacientes VIH- y 593 de pacientes con VIH/sida. Las muestras que lo requerían se le aplicaron descontaminación cultivo, se utilizó el método de ácido sulfúrico al 4 por ciento, para el cultivo se usó el medio de Löwenstein-Jensen. Resultados: de las 825 muestras extra pulmonares en 29 (3,5 por ciento) se obtuvo cultivo positivo,14 (48,3 por ciento) con aislamiento de Mycobacterium tuberculosis (11 VIH+ y 3 VIH-), y 15 (51,7 por ciento) con aislamiento de otras especies micobacterianas (12 VIH+ y 3 VIH-), Mycobacterium avium-intracellulare, y Mycobacterium malmoense fueron las especies más aisladas. Conclusión: por todo lo anterior expuesto se recomienda mantener la vigilancia diagnóstica en este tipo de infección extra pulmonar, en especial en pacientes con sida, pues en muchos casos pueden tener fatales consecuencias por su diagnóstico tardío(AU)

Nuevas herramientas para el diagnóstico de la tuberculosis / New tools for tuberculosis diagnosis

Introducción: en las últimas décadas se han desarrollado nuevas herramientas para disminuir el tiempo de diagnóstico de las infecciones por Mycobacterium tuberculosis. Objetivo: introducir nuevas herramientas para la identificación de M. tuberculosis y comparar los resultados con el cultivo en Löwenstein Jensen. Métodos: se estudiaron 1 368 muestras recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, de agosto 2010 - agosto 2014. Las muestras después de procesadas fueron inoculadas en paralelo en Löwenstein Jensen y en BacT ALERT. Los resultados se ana­lizaron y compararon con relación al total de aislamientos, tiempo de detección de crecimiento y tasa de contaminación, se calcularon además los indicadores de desempeño del BacT ALERT. Resultados: por Bact/ ALERT se identificó Mycobacterium tuberculosis en 126 (98,5 por ciento) muestras y 116 (88,5 por ciento) por el Löwenstein Jensen. El tiempo de detección de crecimiento de Mycobacterium tuberculosis por el BacT/ ALERT fue de 16,6 días, dos veces menor que el obtenido por el Löwenstein Jensen (35,5 días). La tasa de contaminación por el Bact/ ALERT y Löwenstein Jensen fue de 11 por ciento y 7,8 por ciento, respectivamente. La sensibilidad, especificidad e índice de Youden fue de 99,1 por ciento, 99,0 por ciento y 0,98, respectivamente; y el índice de validez del 99 por ciento. Conclusiones: el sistema Bact/ ALERT resultó un método útil porque acortó significativamente el tiempo de diagnóstico de la tuberculosis permitiendo comenzar el tratamiento de forma oportuna, sobre todo en pacientes con baciloscopia negativa. El uso combinado del Löwenstein Jensen y medio líquido aseguró la recuperación del total de cepas de M. tuberculosis(AU)

Background: In recent decades, new tools have been developed to decrease the time of diagnosis of infections with Mycobacterium tuberculosis. Objective: To introduce the new tools for identification of M. tuberculosis and compare the results with culture in Löwenstein Jensen. Methods: 1 368 samples received at the National Tuberculosis Reference Laboratory of the IPK from August 2010 to August 2014. After samples processed were inoculated in parallel on Löwenstein Jensen and BacT ALERT. The results obtained are analyzed and compared with respect to the total isolates, time detection of growth and contamination rate, the performance indicators of BacT ALERT also calculated. Results: By Bact / ALERT were identified Mycobacterium tuberculosis in 126 (98.5 percent) samples and 116 (88.5 percent) by Löwenstein Jensen. The time detection of growth of Mycobacterium tuberculosis by BacT / ALERT was 16.6 days, two times lower than that obtained by the Löwenstein Jensen (35.5 days). The contamination rate by Bact / ALERT and Löwenstein Jensen was 11 percent and 7.8 percent, respectively. The sensitivity, specificity and Youden index was 99.1 percent, 99.0 percent and 0.98, respectively; and the validity index was 99 percent. Conclusions: Bact / ALERT system proved a useful method because it significantly shortened the time of tuberculosis diagnosis and start allowing treatment in a timely manner, especially in smear-negative patients. The combined use of liquid medium and Löwenstein Jensen assured recovery of all strains of Mycobacterium tuberculosis(AU)

Nuevas herramientas para el diagnóstico de la tuberculosis / New tools for tuberculosis diagnosis

Introducción: en las últimas décadas se han desarrollado nuevas herramientas para disminuir el tiempo de diagnóstico de las infecciones por Mycobacterium tuberculosis. Objetivo: introducir nuevas herramientas para la identificación de M. tuberculosis y comparar los resultados con el cultivo en Löwenstein Jensen. Métodos: se estudiaron 1 368 muestras recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, de agosto 2010 - agosto 2014. Las muestras después de procesadas fueron inoculadas en paralelo en Löwenstein Jensen y en BacT ALERT. Los resultados se ana­lizaron y compararon con relación al total de aislamientos, tiempo de detección de crecimiento y tasa de contaminación, se calcularon además los indicadores de desempeño del BacT ALERT. Resultados: por Bact/ ALERT se identificó Mycobacterium tuberculosis en 126 (98,5 por ciento) muestras y 116 (88,5 por ciento) por el Löwenstein Jensen. El tiempo de detección de crecimiento de Mycobacterium tuberculosis por el BacT/ ALERT fue de 16,6 días, dos veces menor que el obtenido por el Löwenstein Jensen (35,5 días). La tasa de contaminación por el Bact/ ALERT y Löwenstein Jensen fue de 11 por ciento y 7,8 por ciento, respectivamente. La sensibilidad, especificidad e índice de Youden fue de 99,1 por ciento, 99,0 por ciento y 0,98, respectivamente; y el índice de validez del 99 por ciento. Conclusiones: el sistema Bact/ ALERT resultó un método útil porque acortó significativamente el tiempo de diagnóstico de la tuberculosis permitiendo comenzar el tratamiento de forma oportuna, sobre todo en pacientes con baciloscopia negativa. El uso combinado del Löwenstein Jensen y medio líquido aseguró la recuperación del total de cepas de M. tuberculosis(AU)

Background: in recent decades, new tools have been developed to decrease the time of diagnosis of infections with Mycobacterium tuberculosis. Objective: to introduce the new tools for identification of M. tuberculosis and compare the results with culture in Löwenstein Jensen. Methods: 1 368 samples received at the National Tuberculosis Reference Laboratory of the IPK from August 2010 to August 2014. After samples processed were inoculated in parallel on Löwenstein Jensen and BacT ALERT. The results obtained are analyzed and compared with respect to the total isolates, time detection of growth and contamination rate, the performance indicators of BacT ALERT also calculated. Results: by Bact / ALERT were identified Mycobacterium tuberculosis in 126 (98.5 percent) samples and 116 (88.5 percent) by Löwenstein Jensen. The time detection of growth of Mycobacterium tuberculosis by BacT / ALERT was 16.6 days, two times lower than that obtained by the Löwenstein Jensen (35.5 days). The contamination rate by Bact / ALERT and Löwenstein Jensen was 11 percent and 7.8 percent, respectively. The sensitivity, specificity and Youden index was 99.1 percent, 99.0 percent and 0.98, respectively; and the validity index was 99 percent. Conclusions: bact / ALERT system proved a useful method because it significantly shortened the time of tuberculosis diagnosis and start allowing treatment in a timely manner, especially in smear-negative patients. The combined use of liquid medium and Löwenstein Jensen assured recovery of all strains of Mycobacterium tuberculosis(AU)

Coinfección por Mycobacterium malmoense y Mycobacterium tuberculosis en paciente con el síndrome deinmunodeficiencia humana / Coinfection of Mycobacterium malmoense and Mycobacterium tuberculosis in a patient with Acquired inmune deficiency syndrome

Se presenta un caso de coinfección por Mycobacterium malmoense y Mycobacterium tuberculosis en un paciente cubano con síndrome de inmunodeficiencia adquirida (sida), que producía enfermedad respiratoria y hepática respectivamente. Los cultivos realizados a partir de las muestras de esputo demostraron la presencia de una cepa micobacteriana no pigmentada de crecimiento lento perteneciente al grupo III de Runyon e identificada como Mycobacterium malmoense. A partir de los cultivos del tejido hepático extraído laparoscópicamente se aisló una cepa posteriormente identificada como Mycobacterium tuberculosis. El estudio anatomopatológico confirmó el diagnóstico de tuberculosis, el paciente recibió tratamiento específico y evolucionó clínicamente bien. Se reporta un caso infrecuente de coinfección por Mycobacterium, el cual describe el primer reporte de tuberculosis hepática en una paciente con sida en Cuba.

A case is presented of coinfection with Mycobacterium malmoense and Mycobacterium tuberculosis in a Cuban patient with AIDS which produced respiratory and liver disease respectively. Cultures done from sputum samples showed the presence of a non-pigmented, slow growing mycobacterial strain belonging to Runyon group III and identified as Mycobacterium malmoense. From cultures of liver tissue removed laparoscopically, a strain was isolated and subsequently identified as Mycobacterium tuberculosis. Anatomapathologic examination confirmed the diagnosis of tuberculosis, the patient received specific treatment and had a favorable clinical course. This report of a rare case of coinfection of Mycobacterium describes the first report of hepatic tuberculosis in a patient with AIDS in Cuba.

Aspectos clínicos y aislamientos de micobacterias ambientales en muestras pulmonares y extrapulmonares / Clinical aspects and the isolation of environmental mycobacteria in pulmonary and extrapulmonary samples

Las infecciones provocadas por micobacterias atípicas, micobacterias no tuberculosas y más recientemente denominadas micobacterias ambientales u oportunistas, en los últimos tiempos desempeñan un papel preponderante en el diagnóstico clínico. Estas especies se relacionan generalmente con estados de inmuno depresión del paciente. En este trabajo se estudiaron 136 cepas aisladas de pacientes con sintomatología específica tanto pulmonar como extrapulmonar, incluidos aquellos infectados por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), éstas fueron estudiadas e identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias, durante el período de enero de 2011 a diciembre de 2012. Es importante destacar que el 72.79% de los aislamientos eran procedentes de pacientes VIH positivos. El total de las cepas aisladas fue analizado según la clasificación establecida por Runyon; los grupos encontrados con mayor frecuencia fueron el III y el IV; por especie, las de mayor porcentaje de aislamiento fueron las del complejo Mycobacterium avium-intracellulare, Mycobacterium malmoense, Mycobacterium fortuitum y Mycobacterium chelonae, respectivamente. Estos estudios son de gran importancia diagnóstica en los laboratorios de micobacteriología, pues de esta forma se puede llegar a conocer cuáles son las especies micobacterianas predominantes en la población,y lograr establecer una vigilancia sobre este tipo de infecciones, particularmente en pacientes inmunodeficientes, los que pueden ser origen de una peligrosa diseminación de la enfermedad...

[Coinfection of Mycobacterium malmoense and Mycobacterium tuberculosis in a patient with acquired inmune deficiency syndrome]. / Coinfección por Mycobacterium malmoense y Mycobacterium tuberculosis en paciente con el síndrome de inmunodeficiencia humana.

A case is presented of coinfection with Mycobacterium malmoense and Mycobacterium tuberculosis in a Cuban patient with AIDS which produced respiratory and liver disease respectively. Cultures done from sputum samples showed the presence of a non-pigmented, slow growing mycobacterial strain belonging to Runyon group III and identified as Mycobacterium malmoense. From cultures of liver tissue removed laparoscopically, a strain was isolated and subsequently identified as Mycobacterium tuberculosis. Anatomapathologic examination confirmed the diagnosis of tuberculosis, the patient received specific treatment and had a favorable clinical course. This report of a rare case of coinfection of Mycobacterium describes the first report of hepatic tuberculosis in a patient with AIDS in Cuba.

Enfermedad diseminada por Mycobacterium szulgai con compromiso pulmonar y ganglionar en un paciente con sida / Pulmonary infection and dissemination to cervical lymph nodes for Mycobacterium szulgai in AIDS patient

Mycobacterium szulgai es una MNT descrita como nueva especie patógena para el hombre en 1972 por Marks y colaboradores. El aislamiento de esta especie, una de las 115 descritas en el género Mycobacterium, no es frecuente en los seres humanos. M. szulgai es responsable de menos del 1 % de todos los aislamientos de MNT en los seres humanos; por esta razón, su aislamiento siempre se considera como agente patógeno. La presentación clínica de la enfermedad pulmonar producida por este microorganismo suele ser muy similar a la tuberculosis; el diagnóstico se presumirá cuando el tratamiento antituberculoso inicial no produzca la respuesta esperada. Asimismo, también se aísla ocasionalmente en afecciones osteoarticulares, compromiso cutáneo o ganglionar. El objetivo de este estudio fue describir el primer caso en nuestro país de infección respiratoria con diseminación ganglionar por M. szulgai en un paciente cubano con sida.

Enfermedad diseminada por Mycobacterium szulgai con compromiso pulmonar y ganglionar en un paciente con sida / Pulmonary infection and dissemination to cervical lymph nodes for Mycobacterium szulgai in AIDS patient

Mycobacterium szulgai es una MNT descrita como nueva especie patógena para el hombre en 1972 por Marks y colaboradores. El aislamiento de esta especie, una de las 115 descritas en el género Mycobacterium, no es frecuente en los seres humanos. M. szulgai es responsable de menos del 1 % de todos los aislamientos de MNT en los seres humanos; por esta razón, su aislamiento siempre se considera como agente patógeno. La presentación clínica de la enfermedad pulmonar producida por este microorganismo suele ser muy similar a la tuberculosis; el diagnóstico se presumirá cuando el tratamiento antituberculoso inicial no produzca la respuesta esperada. Asimismo, también se aísla ocasionalmente en afecciones osteoarticulares, compromiso cutáneo o ganglionar. El objetivo de este estudio fue describir el primer caso en nuestro país de infección respiratoria con diseminación ganglionar por M. szulgai en un paciente cubano con sida.(AU)

El Laboratorio Nacional de Referencia y su contribución a la eliminación de la tuberculosis en Cuba / The National Laboratory of Reference and its contribution to the elimination of tuberculosis in Cuba

Se describe la participación del Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones en Tuberculosis y Micobacterias del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, en la organización del recurso bacteriológico para el diagnóstico y la búsqueda de casos, fundamentalmente en la atención primaria de salud, en apoyo al Programa Nacional de Control de la Tuberculosis. Se hace referencia a las funciones y principales actividades científicas de este Laboratorio Nacional, Centro Colaborador OPS/OMS, como cabecera de los laboratorios de la red de diagnóstico de la tuberculosis en el país. La introducción y aplicación de nuevas tecnologías de avanzada permite contar con valiosas herramientas para dar respuesta a los diferentes retos que plantean la tuberculosis y las micobacteriosis en la actualidad. Con la ejecución de un proyecto del fondo mundial de lucha contra el sida, la tuberculosis y la malaria, se ha fortalecido la red de diagnóstico, lo que debe contribuir, en un futuro cercano, a la eliminación de la tuberculosis como problema de salud en Cuba

The participation of the National Laboratory of Reference and Research on Tuberculosis and Mycobacteria of Pedro Kouri Institute of Tropical Medicine in the organization of the bacteriological resources for the diagnosis and screening of cases in the primary health care, in support of the national program for control of tuberculosis, was described in this paper. Reference was made to the functions and main scientific activities of this laboratory, which is a PAHO/WHO collaborating center at the forefront of the tuberculosis diagnosis laboratory network in the country. The introduction and the implementation of state-of-the-art technologies have allowed valuable tools to be used to meet several challenges posed by tuberculosis and mycobacteria nowadays. Thanks to the implementation of a World Fund against AIDS, tuberculosis and malaria project, the diagnosis network has strengthened, which must contribute to the elimination of tuberculosis as a health problem in Cuba in the near future

El Laboratorio Nacional de Referencia y su contribución a la eliminación de la tuberculosis en Cuba / The National Laboratory of Reference and its contribution to the elimination of tuberculosis in Cuba

Se describe la participación del Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones en Tuberculosis y Micobacterias del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, en la organización del recurso bacteriológico para el diagnóstico y la búsqueda de casos, fundamentalmente en la atención primaria de salud, en apoyo al Programa Nacional de Control de la Tuberculosis. Se hace referencia a las funciones y principales actividades científicas de este Laboratorio Nacional, Centro Colaborador OPS/OMS, como cabecera de los laboratorios de la red de diagnóstico de la tuberculosis en el país. La introducción y aplicación de nuevas tecnologías de avanzada permite contar con valiosas herramientas para dar respuesta a los diferentes retos que plantean la tuberculosis y las micobacteriosis en la actualidad. Con la ejecución de un proyecto del fondo mundial de lucha contra el sida, la tuberculosis y la malaria, se ha fortalecido la red de diagnóstico, lo que debe contribuir, en un futuro cercano, a la eliminación de la tuberculosis como problema de salud en Cuba(AU)

The participation of the National Laboratory of Reference and Research on Tuberculosis and Mycobacteria of Pedro Kouri Institute of Tropical Medicine in the organization of the bacteriological resources for the diagnosis and screening of cases in the primary health care, in support of the national program for control of tuberculosis, was described in this paper. Reference was made to the functions and main scientific activities of this laboratory, which is a PAHO/WHO collaborating center at the forefront of the tuberculosis diagnosis laboratory network in the country. The introduction and the implementation of state-of-the-art technologies have allowed valuable tools to be used to meet several challenges posed by tuberculosis and mycobacteria nowadays. Thanks to the implementation of a World Fund against AIDS, tuberculosis and malaria project, the diagnosis network has strengthened, which must contribute to the elimination of tuberculosis as a health problem in Cuba in the near future(AU)